華大基因推出基于GPU加速的DNA定序服務
2012-05-23 22:21:07 本站原創英偉達公司宣布，全球最大的基因組研究所華大基因正在推出一項服務，該服務讓世界各地的研究人員能夠以較低的價格在云端執行下一代定序(NGS)生物信息學分析。
全新的“EasyGenomics ” 服務由位于中國深圳的華大基因提供，該項服務將直觀的用戶界面與華大基因自動化的流水線分析、軟件以及工具相結合。它們與業內最大的定序平臺集成在一起，為生物學家、生物信息學家以及最終為內科醫生提供所需的全部內容，使其能夠提交和收到DNA定序數據的自動化分析。
英偉達GPU可加速處理大型DNA數據分析，與使用基于CPU的系統相比，能夠令處理時間從數日縮短至區區數小時。EasyGenomics由英偉達GPU加速，因而為全球研究人員大大擴展了高級基因組研究功能的可用性，讓科學離低價可行的個性化藥品時代更近一步。
針對2012年Bio-IT World展會上符合資格要求的生物學家和生物信息學家，華大基因現在正在推出這項全新服務的有限免費試用。如需了解更多信息或如需申請免費試用，敬請訪問EasyGenomics網站。
華大基因副總裁方林(音譯)博士表示：“通過讓更多研究人員以更低的價格更輕松地加速DNA定序數據，我們希望能夠便于醫生在臨床診斷以及復雜的疾病研究中把運用基因組作為醫療工作的一個可行的組成部分。GPU加速讓科學家能夠比以往更快地分析DNA定序數據，將所用的時間從五天縮短至短短五個小時。 在云端充分完成部署之后，我們預計EasyGenomics將在基因組研究領域中掀起革命。”
EasyGenomics云服務采用基于英偉達(NVIDIA) Tesla M2070和M2075 GPU的混合型計算系統，這些 GPU連同系統CPU一起為DNA定序數據分析加速。當EasyGenomics服務充分完成部署時，華大基因計劃新增數以百計的英偉達Tesla GPU來對其進行升級，屆時預計該服務將支持數以千計的用戶。
英偉達公司Tesla事業部高級總監Sumit Gupta表示：“由于定序成本的下降，今年或將成為1,000美元基因組之年。我們很快將淹沒在基因組定序的海量數據當中。華大基因的EasyGenomics服務利用GPU計算的處理能力來為科學家提供一條低價且簡單易用的途徑，使其能夠輕松解決這種全新的大型基因數據問題，讓我們能夠離有效而低價的個性化醫療更近一步。”
從植物與大腸桿菌到大熊貓，在對各種生命形式進行基因組定序這方面，華大基因從事著開創性的工作，目的是開發出更好的藥物、改善醫療以及開發出基因更優秀的食物。 華大基因總部位于中國深圳，在美國馬薩諸塞州坎布里奇和丹麥哥本哈根設有分支機構，其目標是讓最前沿的基因組科學得到普及。
