華大基因推出基于GPU加速的DNA定序服務
2012-05-23 22:21:07 本站原創(chuàng)英偉達公司宣布，全球最大的基因組研究所華大基因正在推出一項服務，該服務讓世界各地的研究人員能夠以較低的價格在云端執(zhí)行下一代定序(NGS)生物信息學分析。
全新的“EasyGenomics ” 服務由位于中國深圳的華大基因提供，該項服務將直觀的用戶界面與華大基因自動化的流水線分析、軟件以及工具相結合。它們與業(yè)內最大的定序平臺集成在一起，為生物學家、生物信息學家以及最終為內科醫(yī)生提供所需的全部內容，使其能夠提交和收到DNA定序數據的自動化分析。
英偉達GPU可加速處理大型DNA數據分析，與使用基于CPU的系統(tǒng)相比，能夠令處理時間從數日縮短至區(qū)區(qū)數小時。EasyGenomics由英偉達GPU加速，因而為全球研究人員大大擴展了高級基因組研究功能的可用性，讓科學離低價可行的個性化藥品時代更近一步。
針對2012年Bio-IT World展會上符合資格要求的生物學家和生物信息學家，華大基因現(xiàn)在正在推出這項全新服務的有限免費試用。如需了解更多信息或如需申請免費試用，敬請訪問EasyGenomics網站。
華大基因副總裁方林(音譯)博士表示：“通過讓更多研究人員以更低的價格更輕松地加速DNA定序數據，我們希望能夠便于醫(yī)生在臨床診斷以及復雜的疾病研究中把運用基因組作為醫(yī)療工作的一個可行的組成部分。GPU加速讓科學家能夠比以往更快地分析DNA定序數據，將所用的時間從五天縮短至短短五個小時。 在云端充分完成部署之后，我們預計EasyGenomics將在基因組研究領域中掀起革命。”
EasyGenomics云服務采用基于英偉達(NVIDIA) Tesla M2070和M2075 GPU的混合型計算系統(tǒng)，這些 GPU連同系統(tǒng)CPU一起為DNA定序數據分析加速。當EasyGenomics服務充分完成部署時，華大基因計劃新增數以百計的英偉達Tesla GPU來對其進行升級，屆時預計該服務將支持數以千計的用戶。
英偉達公司Tesla事業(yè)部高級總監(jiān)Sumit Gupta表示：“由于定序成本的下降，今年或將成為1,000美元基因組之年。我們很快將淹沒在基因組定序的海量數據當中。華大基因的EasyGenomics服務利用GPU計算的處理能力來為科學家提供一條低價且簡單易用的途徑，使其能夠輕松解決這種全新的大型基因數據問題，讓我們能夠離有效而低價的個性化醫(yī)療更近一步。”
從植物與大腸桿菌到大熊貓，在對各種生命形式進行基因組定序這方面，華大基因從事著開創(chuàng)性的工作，目的是開發(fā)出更好的藥物、改善醫(yī)療以及開發(fā)出基因更優(yōu)秀的食物。 華大基因總部位于中國深圳，在美國馬薩諸塞州坎布里奇和丹麥哥本哈根設有分支機構，其目標是讓最前沿的基因組科學得到普及。
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